โรงเรียนกรรณสูตศึกษาลัย สุพรรณบุรี มาจากโรงเรียน ๒ โรงเรียน คือ โรงเรียนปรีชาพิทยาคาร และ โรงเรียนวัดประตูสาร โดยในปี พ.ศ. ๒๔๕๓ ทางการ ได้ยุบโรงเรียนวัดประตูสาร ไปรวมกับ โรงเรียน ปรีชาพิทยาคาร และกำหนดฐานะให้ เป็นโรงเรียน ประจำจังหวัดสุพรรณบุรี และ ต่อมา ได้พัฒนาเป็น โรงเรียนกรรณสูตศึกษาลัย ในปัจจุบัน
โรงเรียนกรรณสูตศึกษาลัย จังหวัดสุพรรณบุรี ปัจจุบันตั้งอยู่เลขที่ 440 ถนนมาลัยแมน ตำบลรั้วใหญ่ อำเภอเมือง จังหวัดสุพรรณบุรี บริเวณที่ตั้งของโรงเรียนตั้งอยู่ด้านฝั่งตะวันตกของแม่น้ำท่าจีน ฝั่งขวาถนนมาลัยแมน ระยะห่างจากตัวเมืองสุพรรณบุรี ประมาณ 2.5 กิโลเมตร มีเนื้อที่ 48 ไร่
ด้านทิศเหนือ-ติดกับลำรางสาธารณะและที่ดินส่วนบุคคล (ด้านหลังโรงเรียน) ด้านทิศใต้-ติดต่อกับถนนมาลัยแมน (ด้านหน้าโรงเรียน) ด้านทิศตะวันออก-ติดต่อกับหมู่บ้านจัดสรรของบริษัทสุพรรณแลนด์ แอนด์ เฮ้าส์ ด้านทิศตะวันตก-ติดต่อกับชุมชนหมู่บ้านวัดป่าเลไลยก์
โรงเรียนกรรณสูตศึกษาลัย จังหวัดสุพรรณบุรี ตั้งอยู่ในเขตตำบลรั้วใหญ่ ที่ตั้งของตำบล รั้วใหญ่ ตั้งอยู่ทางทิศตะวันตกของอำเภอเมืองสุพรรณบุรี ห่างจากที่ว่าการอำเภอประมาณ 3 กิโลเมตร จังหวัดสุพรรณบุรีมีอาณาเขตพื้นที่ประมาณ 12,167 ไร่ ลักษณะพื้นที่ส่วนใหญ่เป็นที่ราบลุ่ม มีทรัพยากรดินและน้ำอุดมสมบูรณ์เหมาะสมสำหรับทำเกษตรกรรม พื้นที่บางส่วนเป็นที่ดอนน้ำท่วมไม่ถึง ทางทิศตะวันออกของตำบลมีแม่น้ำไหลผ่านเป็นแนวแบ่งเขตระหว่างตำบล รั้วใหญ่กับตำบลสนามชัย และตำบลท่าพี่เลี้ยง พื้นที่ของตำบลรั้วใหญ่ไม่เป็นผืนเดียวกัน โดยมีจุดกลางเป็นเขตเทศบาลเมืองสุพรรณบุรี
